Ülkenin yönetim şekli Anayasal Monarşi’dir. İkinci Dünya Savaşının sonrasında 1947 yılında kabul edilen Anayasa çoğulcu parlamenter sistem getirmiştir. Anayasa uyarınca, İmparator’un görev ve yetkileri tamamen törensel nitelikte olup, yürütme erkinin başı Başbakan’dır.

Ülkede iki kamaralı meclis sistemi bulunmaktadır. Ulusal Meclis Anayasa’da “en üst devlet kurumu” olarak tanımlanmaktadır. Temsilciler Meclisi (Alt Meclis) üye sayısı 465, Danışmanlar Meclisi (Senato / Üst Meclis) üye sayısı ise 248’dir.

Ulusal Meclis; Başbakan’ın atanması, Hükümet’in feshedilmesi ve bütçenin onaylanmasında temel belirleyici kurumdur. Temsilciler Meclisi anayasal olarak Danışmanlar Meclisi’ne göre daha güçlü bir konumdadır. Temel konulardaki bazı kararlarda sadece Temsilciler Meclisi söz sahibi olup, Danışmanlar Meclisi tarafından alınan kararları da üçte iki çoğunlukla reddetme yetkisine sahiptir.

Ülkenin halihazırdaki Başbakanı Sanae Takaichi’dir. (2025 yılı Ekim ayında görevine başlamıştır.)

Japonya Başbakanı Sanae Takachi’nin 23 Ocak’ta Temsilciler Meclisi’ni feshetmesi üzerine 8 Şubat’ta gerçekleştirilen Temsilciler Meclisi genel seçimlerinde iktidardaki Liberal Demokrat Parti 316 sandalye kazanarak birinci parti olmuş ve tek başına mecliste çoğunluk için gereken 233 milletvekiline koalisyon ortağı Nippon Isshin’in desteği olmadan ulaşmış, bu sonuçla, üçte iki çoğunluğu dahi sağlayarak tarihi bir başarı kaydetmiştir.

Seçimlerde Sanseito ve “Gelecek Takımı” partileri oy oranlarını yükseltirken, Japonya Komünist Partisi, Reiwa Partisi ve Sosyal Demokrat Parti oylarında düşüş yaşanmıştır. Seçime birlikte giren ana muhalefetteki Anayasal Demokrat Parti ve Komeito ise seçimlerden önce Temsilciler Meclisi’ndeki sandalyelerinin yüzde 70’ini kaybetmiştir.