Türkiye, 16 Aralık 1991 tarihinde Kırgız Cumhuriyeti’nin bağımsızlığını tanıyan ilk ülke olmuş ve iki ülke arasında 29 Ocak 1992 tarihinde diplomatik ilişki tesis edilmiştir. 1992 yılı içerisinde karşılıklı olarak Bişkek ve Ankara’da Büyükelçilikler açılmıştır. Türkiye Bişkek’te Büyükelçilik açan ilk ülkedir.
Türkiye ile Kırgızistan arasındaki kardeşlik ilişkileri; ortak tarihi, kültürel ve manevi bağlara dayanmaktadır. Bu sağlam temeller üzerine inşa edilen ilişkiler çok boyutlu bir stratejik ortaklığa dönüşmüş, iki ülke arasında imzalanan çok sayıdaki anlaşma ve protokol, işbirliğinin hukuki altyapısını oluşturmuştur.
İlk toplantısı 2011 yılında düzenlenen Yüksek Düzeyli Stratejik İşbirliği Konseyi (YDSK) ise ilişkilerin en üst düzeyde kurumsallaşmasını sağlamıştır. İlişkiler 5 Kasım 2024 tarihinde düzenlenen YDSK 6. Toplantısı neticesinde “stratejik ortaklık” düzeyinden “kapsamlı stratejik ortaklık” düzeyine yükseltilmiştir.
İkili ilişkiler, Karma Ekonomik Komisyon (KEK) ve Ortak Stratejik Planlama Grubu (OSPG) gibi faal mekanizmalar aracılığıyla da kurumsal düzeyde sürdürülmektedir.
Sağlık ve eğitim iki ülke arasındaki temel işbirliği alanları arasındadır. TİKA tarafından yapımı tamamlanan Recep Tayyip Erdoğan Bişkek Kırgız-Türk Dostluk Devlet Hastanesi 15 Ekim 2021 tarihinden beri hasta kabul etmektedir. Sayın Cumhurbaşkanımız ve Kırgızistan Cumhurbaşkanı Sayın Sadır Caparov 5 Kasım 2024 tarihinde hastanenin resmi açılışını gerçekleştirmişlerdir.
Dünyadaki ilk 1000 üniversite arasında bulunan Kırgızistan-Türkiye Manas Üniversitesi 1997-1998 eğitim-öğretim yılında faaliyete geçmiştir.
Kırgızistan’da yaşayan Ahıska Türkleri ve Karadeniz Türkleri ile 1980’li yıllarda Van’ın Erciş ilçesine yerleştirilen Ulupamir Kırgızları iki ülke arasındaki insani bağları güçlendirmektedir.